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國際計算生物學學會（ISCB）近日發(fā)布消息，計算生物學家、清華大學智能產(chǎn)業(yè)研究院卓越訪問教授許錦波當選ISCB Fellow，當選理由為通過開創(chuàng)全新計算方式及軟件程序，為蛋白質結構預測帶來顛覆性變革。
據(jù)介紹，ISCB成立于1997年，是計算生物學與生物信息學領域最重要的國際學術組織。ISCB Fellow則是基于學者所做科學貢獻的重要性進行遴選，旨在表彰在計算生物學和生物信息學領域做出重大貢獻的學者，如2013年諾貝爾化學獎得主邁克爾·萊維特、現(xiàn)代信息論專家李明等。從2009年ISCB開始Fellow評選至今，平均每年當選科學家僅八名。
據(jù)了解，許錦波是麻省理工學院博士后，曾任美國芝加哥豐田計算技術研究所終身教授、基因測序巨頭Illumina的高級研究員，多次榮獲美國斯隆研究獎、美國自然科學基金早期職業(yè)獎、國際計算生物學頂級會議RECOMB最佳論文獎和時間檢驗獎等國際頂級獎項。許錦波2016年提出第一個AI蛋白質折疊算法RaptorX-Contact，首次證明深度學習方法預測蛋白質結構的可行性，實現(xiàn)了AI蛋白質結構預測從0到1的突破。
AI蛋白質結構預測解開了困擾科學家們近60年的難題，對產(chǎn)業(yè)意義重大?；谶@一技術，靶標蛋白繪制的速度大幅提升，創(chuàng)新藥研發(fā)迎來新的機遇。合成生物學領域也可以基于這一技術，對催化酶等核心要素進行機理分析，為生物“智”造奠定重要基礎。
“AI蛋白質結構預測的價值，在于對蛋白質設計的推動和驗證。”許錦波表示，AI蛋白質預測只是一個開始，未來生物科技的顛覆性突破、乃至生物經(jīng)濟的重構，關鍵在于AI蛋白質設計技術?！斑\用AI，我們可以根據(jù)特定的功能需求設計自然界不存在的蛋白質或改造已有的蛋白質，將為藥物研發(fā)、高性能材料、環(huán)境保護、綠色農(nóng)業(yè)、食品等領域帶來革命性的變化?！?/p>
2021年，許錦波歸國加入清華大學智能產(chǎn)業(yè)研究院擔任卓越訪問教授，并成立AI蛋白質設計平臺公司分子之心，意在打通科研與產(chǎn)業(yè)壁壘，推動中國自己的AI生命科學發(fā)展。許錦波帶領團隊陸續(xù)推出可同時進行側鏈預測和蛋白質序列設計的AI算法、首個無需模板的蛋白質配體生成算法、首個端到端的蛋白質柔性對接算法等十余項世界領先的AI算法，相關成果多次在《科學》等頂級學術期刊發(fā)表。近期ChatGPT引爆生成式AI浪潮，而許錦波在2019年就使用類似方法開發(fā)蛋白質設計算法，并在AI蛋白質生成大模型上逐步突破，用通用性強的底層算法來構建“基礎設施”，以期更加精準地滿足多元化、個性化的產(chǎn)業(yè)級蛋白質生成需求。
為推進AI蛋白質設計技術發(fā)展和產(chǎn)業(yè)應用，許錦波帶領團隊推出了業(yè)界首個功能完善的AI蛋白質預測、優(yōu)化、設計平臺MoleculeOS，填補了世界范圍內尚沒有功能完整的AI蛋白質設計和優(yōu)化平臺的空白。這一平臺可用“生成”而非“發(fā)現(xiàn)”蛋白質的方法，針對藥物設計、合成生物學等領域的應用需求，設計具有特定功能的蛋白質產(chǎn)品。
“底層技術的突破將是生物科技產(chǎn)業(yè)變革的助燃劑。”許錦波表示，希望能用世界領先的AI蛋白底層技術，助推中國的技術和產(chǎn)業(yè)取得競爭優(yōu)勢。
